来那替尼可能会导致严重的副作用，可能会产生严重或持续腹泻；排尿时疼痛或烧灼感；肾脏问题——排尿很少或没有，脚或脚踝肿胀，感到疲倦或气短或者肝脏问题-右侧上腹痛、呕吐、疲劳、发热、瘙痒、尿色暗、大便呈粘土色，偏见于(皮肤或眼睛发黄)。如果出现严重不良反应应当立即咨询医生进行治疗。
来那替尼常见的副作用一般见于严重腹泻，甚至导致脱水，严重会危及生命。在接受来那替尼治疗的前2个月，您可能需要服用药物来预防或快速治疗腹泻，具体用药应咨询相关主治医生，医生可能会建议服用抗腹泻药物，例如氯苯哌酰胺在服用来那替尼期间随时可用，止泻药必须严格按照医生的处方来服用。为了最好地控制腹泻，用药期间可能需要遵循特殊的饮食。熟悉患者本人应该吃或避免的食物清单，来帮助控制腹泻，有时可能还需要喝额外的液体防止脱水。如果患者在1天内排便超过2次，应立即咨询相关医生。