由于临床试验是在各种条件下进行的，因此无法将一种药物临床试验中观察到的不良反应发生率与另一种药物临床试验中的发生率进行直接比较，也无法反映临床实践中观察到的发生率。
在两项临床研究中评估了Hemgenix的安全性(第一项研究招募了3名受试者，第二项研究招募了54名受试者)。两项研究均纳入了中度严重或重度血友病B的成年男性受试者(N = 57)，他们接受了2 × 1013 gc/kg体重的Hemgenix单次静脉给药。所有受试者均进入5年的随访期。
在19名受试者中观察到输注相关反应。3名受试者的输注暂时中断，在用抗组胺药和/或皮质类固醇治疗后以较慢的输注速率恢复。在一名受试者中，停止输注而不恢复。
有24名受试者在给药后第8天至第731天出现ALT值升高。五名受试者的ALT升高> 2-3倍ULN(范围= 89国际单位/升-130国际单位/升)，一名受试者的ALT升高> 3-5倍ULN (193国际单位/升)，一名受试者的ALT升高> 5倍ULN (275国际单位/升)。ALT升高> 5倍ULN的受试者发生在Hemgenix给药3周后。
5名受试者AST升高> 2-3倍ULN(范围= 71 IU/L-118 IU/L)，3名受试者AST升高> 3-5倍ULN(范围= 127 IU/L-163 IU/L)，1名受试者AST升高> 5倍ULN (327 IU/L)。AST升高> 5倍ULN的受试者发生在Hemgenix给药后11个月。 17名受试者在Hemgenix输注后的前4个月内出现ALT水平升高(范围= 41 IU/L-275 IU/L)，其中11名受试者的ALT水平在输注后4个月内消退(范围= 41 IU/L-275 IU/L)，其中5名受试者的ALT水平自最后一次随访(2年随访值范围= 48 IU/L-110 IU/L)起从未恢复正常。另有7名受试者出现ALT升高，发病时间为6至24个月(范围= 42 IU/L-193 IU/L)，其中5名受试者有转氨酶升高的其他风险因素，包括丙型肝炎和人类免疫缺陷病毒(HIV)。在3名ALT升高且发病时间为第6至24个月的受试者中，ALT水平自上次随访以来从未恢复正常(2年随访时的值范围= (59 IU/L- 193 IU/L)。
19名受试者在Hemgenix输注后3个月内出现AST水平升高(范围= 32 IU/L- 163 IU/L)。其中9名受试者的AST升高在输注后4个月内消退(范围= 35 IU/L-163 IU/L)，3名在输注后7至13个月内消退(范围= 35 IU/L-62 IU/L)，其中7名受试者的AST水平自上次随访以来从未恢复正常(2年随访值范围= 36 IU/L-327 IU/L)。其余5名AST升高的受试者在输注后6个月至2年之间发病(范围= 36 IU/L–127 IU/L)，有1名受试者(2年随访时的AST = 127 IU/L)在最后一次随访时AST水平尚未恢复正常，他们有转氨酶水平升高的其他风险因素。
9名ALT升高的受试者接受了皮质类固醇的减量疗程。ALT升高的皮质类固醇治疗平均持续时间为81.4天。在24名ALT升高的受试者中，有19名也有相关的AST升高。21名受试者转氨酶水平升高，未接受皮质类固醇治疗。
输注相关反应:7名受试者在输注过程中出现症状，12名受试者在输注后出现症状。≥ 5%的受试者出现的症状有:头晕、流感样症状和头痛。< 5%的受试者出现的症状有:腹痛、腹部不适、胸部不适、寒战、眼部瘙痒、发热(发热)、潮红、荨麻疹、输液部位反应和心动过速。11名受试者在输注当天或输注后第1天康复。8名受试者在输注后8天内康复。
在2次超敏反应中-开始服用Hemgenix12分钟后，患者出现高血压、眼睛发红、感觉发热、头晕、咳嗽、呼吸困难、心率加快、颤抖和腿部痉挛。输液停止，未重新开始。仅服用了10%的Hemgenix剂量。患者在接受静脉注射苯海拉明和肌肉注射肾上腺素治疗后于当天康复。
2例超敏反应中的2例-开始服用Hemgenix10分钟后，患者出现瘙痒、喉咙发紧和右侧颈部肿胀。未中断Hemgenix给药，而是全部给药。所有症状均在当天消退，无需治疗。