视网膜色素上皮脱离(RPED)：佩米替尼Pemigatinib可以导致RPED，患者可能会有视力模糊，视觉飞蚊症或光感等症状。在635名接受临床试验的起始剂量为13.5 mg的培美曲塞的患者中，11%的患者发生RPED，包括1.3%的3-4级RPED。首次出现RPED的平均时间为56天。RPED导致3.1%的患者停止服用培美曲塞，1.3%的患者减少剂量，0.2%的患者永久停药。76%因RPED而需要调整培美曲塞剂量的患者的RPED缓解或改善至1级水平。
所以在使用药物时要注意：进行全面的眼科检查，包括在开始使用佩米替尼Pemigatinib前进行OCT检查，在前6个月每2个月检查一次，在治疗期间每3个月检查一次。对于出现的视觉症状，应立即让患者接受眼科评估，每3周随访一次，直至症状消失或停用佩米替尼Pemigatinib。按照建议修改剂量或永久停用培美曲塞。
在635名临床试验中接受起始剂量为13.5 mg的培美曲塞的患者中，31%的患者出现干眼，其中1.6%的患者出现3-4级干眼。根据需要用眼部镇痛剂治疗患者。
高磷血症和软组织矿化：可引起高磷血症，导致软组织矿化、皮肤钙化、钙质沉着和非尿毒症性钙过敏。磷酸盐水平的增加是佩米替尼Pemigatinib的药效作用。在635名临床试验中接受起始剂量为13.5 mg的佩米替尼Pemigatinib的患者中，根据高于正常值上限的实验室值，93%的患者报告了高磷血症。高磷血症发病的中位时间为8天(范围1-169)。33%接受佩米替尼Pemigatinib治疗的患者需要降磷酸盐治疗。
注意在使用药物是监测高磷血症，当血清磷酸盐水平为大于 5.5毫克/分升时，开始低磷酸盐饮食。对于血清磷酸盐水平大于 7 mg/dL，开始降磷酸盐治疗，并根据高磷血症的持续时间和严重程度，暂停、减少剂量或永久停用培美唑。
胚胎-胎儿毒性：基于动物研究的发现及其作用机制，当对孕妇施用苯并芘时，会导致胎儿损伤。根据13.5 mg的临床剂量下的曲线下面积(AUC)，在器官发生期对怀孕大鼠口服培美他尼导致胎儿畸形、胎儿生长迟缓和胚胎-胎儿死亡，母体暴露低于人类暴露。
建议有生育能力的女性患者在接受佩米替尼Pemigatinib治疗期间以及最后一次给药后1周内使用有效的避孕措施。建议有潜在生殖能力的女性伴侣的男性在接受佩米替尼Pemigatinib治疗期间以及最后一次给药后1周内使用有效的避孕措施。