出血风险：由于氟维司群是肌内给药，因此有出血倾向、血小板减少或使用抗凝剂的患者应慎用。
肝损伤患者的暴露增加：在一项对7名中度肝功能损害(Child-Pugh B级)和7名肝功能正常的受试者进行的研究中，评估了氟维司群的安全性和药代动力学。中度肝功能损害患者的暴露量增加，因此建议剂量为250毫克。尚未对严重肝功能损害(Child-Pugh C级)的患者进行氟维司群研究。
注射部位反应：注射部位相关事件包括坐骨神经痛、神经痛、神经性疼痛和周围神经病变。由于接近潜在的坐骨神经，在背侧注射部位使用氟维司群时应谨慎。
胚胎-胎儿毒性：基于动物研究的发现及其作用机制，当给孕妇施用氟维司群时，可导致胎儿损伤。在动物生殖研究中，在器官形成期间对怀孕大鼠和兔子施用氟维司群导致胚胎-胎儿毒性，其每日剂量明显低于人类最大推荐剂量。告知孕妇对胎儿的潜在风险。建议有生育能力的女性在氟维司群治疗期间和最后一次给药后一年内使用有效的避孕措施。
血清雌二醇的免疫测定：由于氟维司群和雌二醇的结构相似，氟维司群可以干扰通过免疫测定法进行的雌二醇测定，导致雌二醇水平的错误升高。