阿卡替尼可能会导致严重的副作用，包括：
1. 严重感染
在接受阿卡替尼治疗的患者中，曾发生过严重感染事件。在临床试验中，1029名接受于阿卡替尼治疗的患者中有19%发生了严重或3级或更高级别的感染(细菌、病毒或真菌)，最常见的是呼吸道感染(所有患者的11%，包括6%的肺炎)。医生在治疗期间应监测患者感染的迹象和症状，并及时治疗。
2. 出血
患者在使用阿卡替尼治疗时会发生致命和严重的出血事件。3.0%的患者出现大出血(严重或3级或以上出血或任何中枢神经系统出血)，在临床试验中接受阿卡替尼治疗的1029名患者中，0.1%出现致命性出血，22%的患者发生了其他级别的出血事件。
使用抗血栓药物的同时服用本品可能会进一步增加出血的风险。在临床试验中，2.7%的服用阿卡替尼但未服用抗血栓剂的患者和3.6%的服用卡奎林但服用抗血栓剂的患者出现大出血。考虑抗血栓药物与阿卡替尼合用时的风险和益处。监测病人是否有出血的迹象。
根据手术类型和出血风险，考虑术前和术后3-7天停药的利弊。
3. 血细胞减少症
阿卡替尼有可能导致3或4级血细胞减少症，包括中性粒细胞减少症(23%)、贫血(8%)、血小板减少症(7%)和淋巴细胞减少症(7%)，出现在接受阿卡替尼治疗的患者中，12%的患者出现4级中性粒细胞减少症。治疗期间定期监测全血细胞计数，根据需要中断治疗、减少剂量或停止治疗。
4. 第二原发恶性肿瘤
第二原发性恶性肿瘤，包括皮肤癌和其他实体瘤，在临床试验中1029名接受阿卡替尼治疗的患者中有12%发生。最常见的第二原发恶性肿瘤是皮肤癌，据报道有6%的患者患有皮肤癌。
5. 心房颤动和扑动
在1029名接受阿卡替尼治疗的患者中，1.1%出现3级房颤或房扑，4.1%出现所有级别的房颤或房扑。应监测患者心律失常症状(如心悸、头晕、晕厥、呼吸困难)并进行适当处理。
阿卡替尼最常见的副作用包括头痛、腹泻、肌肉和关节痛、上呼吸道感染和瘀伤等。